Avaliku halduse instituut (algse nimega Humanitaar- ja sotsiaalteaduste instituut) asutati 1992. aastal. Alates 2008. aastast kannab instituut Avaliku halduse instituudi nime.
Alates 2004. aastast juhib instituuti innovatsioonipoliitika ja tehnoloogia valitsemise professor Rainer Kattel.
Õppetoolid hoolitsevad oma valdkonna kursuste õpetamise ja uurimistööde juhendamise eest ning osalevad vastavalt oma uurimisteemadele rahvusvahelises teaduskoostöös.
Instituudis töötab kokku ca 25 teadus- ja õppetööga seotud inimest, kellest 1/3 on professorid ning ülejäänud noorema taseme akadeemilised töötajad (teadurid, lektorid, assistendid). Keskmiselt kaastakse igal semestril õppetööse ka 5-10 avaliku sektori praktikut, kes omavad pikaajalist töökogemust ning vajalikku akadeemilist baasi kõrgetasemelise õppetöö läbiviimiseks.